В обязанности отдела входят прием рецептов от населения и требований от лечебно-профилактических учреждений, изготовление и отпуск по ним лекарств. В составе отдела рецептурная (где осуществляется прием рецептов и выдача по ним лекарств), ассистентская, где изготовляются лекарства, и асептическая комната для изготовления стерильных лекарств. При отсутствии асептической комнаты изготовление стерильных лекарств осуществляется в изолированной застекленной кабине (боксе), располагаемой в ассистентской, или в ящике специальной конструкции - настольном боксе, помещаемом на ассистентском столе.