Отдел запасов служит для хранения всех запасов медикаментов, перевязочных материалов, предметов ухода за больными и других аптекарских товаров. В аптеках всех категорий, кроме I, запасы медицинских товаров находятся в материальных комнатах отдела рецептурно-производственного и запасов.